１階
（い）ホール
講演会、コンサート、映画上映会などのイベントを開催しています。
面積178.3㎡、固定座席数140席（テーブル付）
（ろ）資料閲覧室（レファレンスルーム）
当館が収蔵する図書資料と古文書資料を閲覧することができます。長崎学に関する質問の受付や相談にも応じています。
（は）長崎県産品ショップ
地元のおいしいものや特産品、レアなグッズを取り揃えています。長崎ならではのおみやげを探すならココで。
（に）エントランスホール
博物館の顔として皆様をお迎えします。ミュージアムコンサートや展示会、茶会などのイベントも開催しています。
（ほ）講座室
各種会合、講座などに活用しています。
面積66.2㎡、座席数45席。
（へ）ロッカー室
コイン返却式ロッカーです。大きい手荷物はこちらにお預けください。
小サイズ：37個／大サイズ：6個
（と）ミュージアムショップ
当館で開催した展覧会の図録や長崎の歴史に関する本などのレアな書籍類や、収蔵品をモチーフにしたオリジナルグッズ、和雑貨、長崎の伝統工芸品など多彩な商品を取り揃えています。
（ち）会議室
各種講座、会議などに活用しています。会合の規模によって、２室または３室につなげることもできます。全３室。
面積16.8㎡、座席数８席／１室
（り）駐車場
屋内駐車場（有料）一般車両／62台 大型バス／5台 合計67台
※駐車台数には限りがありますので、出来る限り公共交通機関をご利用ください。
