展覧会図録
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大鉄道展 -ながさき鉄道ものがたり-
（昭和への旅は列車に乗って 大鉄道博覧会）（完売）
開催期間：平成21年（2009）4月18日（土）～6月15日（月）
吉村作治の新発見！エジプト展 国立カイロ博物館所蔵品と（完売）
開催期間：平成21年（2009）2月7日（土）～4月5日（月）
開催期間：平成20年（2008）11月1日（土）～平成21年（2009）1月12日（月）
開催期間：平成20年（2008）9月13日（土）～10月20日（月）
開催期間：[前期] 平成20年（2008）6月14日（土）～7月14日（月）
[後期] 平成20年（2008）7月18日（金）～8月31日（日）
ノリタケデザイン100年の歴史
オールドノリタケからディナーウェアまで（完売）
開催期間：平成20年（2008）4月12日（土）～6月1日（日）
開催期間：平成20年（2008）3月5日（水）～3月31日（月）
開催期間：平成19年（2007）12月21日（金）～平成20年（2008）2月24日（日）
日蘭修好150周年記念事業 開館2周年記念特別展
勝海舟と幕末長崎（完売）
開催期間：平成19年（2007）11月3日（土）～12月9日（日）
開催期間：平成19年（2007）9月29日（土）～10月21日（日）
開催期間：平成19年（2007）7月7日（土）～9月2日（日）
もうひとつの日米交流史 青い目の人形と長崎瓊子展
～あれから80年、きずな未来へ～ （完売）
開催期間：平成19年（2007）4月7日（土）～6月10日（日）
開催期間：平成19年（2007）2月24日（土）～3月25日（日）
早稲田大学創立125周年記念
吉村作治の早大エジプト発掘40年展（完売）
開催期間：平成18年（2006）12月22日（金）～平成19年（2007）2月14日（水）
開館一周年記念特別展
「ローマを夢みた美少年 天正遣欧使節と天草四郎展」（完売）
開催期間：平成18年（2006）10月21日（土）～12月13日（水）
開館一周年記念展
「くんち 三七二年展 大諏訪の神宝と祭礼」
開催期間：平成18年（2006）9月13日（水）～10月15日（日）
特別企画展「脳！-内なる不思議の世界へ」
Ｂｒａｉｎ！ Ｅｘｐｌｏｒｉｎｇ Ｗｏｎｄｒｏｕｓ Ｍｙｓｔｅｒｉｅｓ（完売）
開催期間：平成18年（2006）7月15日（土）～9月3日（日）
開かれた港市 平戸の至宝とキリシタン文化展
松浦家の名品と甦るオランダ商館
開催期間：平成18年（2006）6月10日（土）～7月9日（日）
日露修好150周年記念「ロマノフ王朝と近代日本」展
版画と写真でたどる日露交流
－ロシア国立図書館所蔵品より－（完売）
開催期間：平成18年（2006）4月27日（木）～6月4日（日）
開催期間：平成18年3月18日（土）～4月16日（日）